Il clima di Alcobaça è oceanico mite, con inverni miti e piovosi ed estati piacevolmente calde e soleggiate.
La città si trova nel Portogallo centrale, a circa 10 km dall'oceano, dove si trova Nazaré. In estate in genere le temperature sono piacevoli, e a volte anche un po' fresche. Ci possono essere alcune giornate molto calde, ma anche in questi casi, in genere di notte la temperatura diminuisce di molto.
La temperatura media del mese più freddo (gennaio) è di 9,7 °C, quella dei mesi più caldi (luglio, agosto) è di 20,3 °C. Il record del freddo (del periodo 1971/2000) è di -5,5 °C, il record del caldo è di 40,8 °C. Ecco le temperature medie.

Le precipitazioni ammontano a 840 mm all'anno: sono dunque ad un livello intermedio. Nei mesi meno piovosi (luglio, agosto) cadono 10 mm di pioggia, nel più piovoso (dicembre) ne cadono 130. Ecco le precipitazioni medie.
 
In media, si contano circa 2.930 ore di sole all'anno: dunque, il soleggiamento è molto buono. Ecco la media delle ore di sole al giorno.
 
La temperatura del mare oscilla tra 14 °C e 19 °C. Non diventa dunque mai calda per fare il bagno. Ecco le temperature medie del mare.

Quando andare

Il periodo migliore per visitare Alcobaça va da giugno a settembre, essendo il più caldo ma soprattutto il meno piovoso dell'anno. Luglio e agosto sono i mesi più caldi, ma raramente il caldo è eccessivo, e in più sono quelli in cui le giornate piovose sono più rare; peraltro, anche a settembre le piogge sono ancora abbastanza rare. A maggio si può andare, ma le giornate fresche e piovose sono più frequenti.
Anche in estate conviene portare una felpa, e magari una giacca leggera per la sera.