Il clima di Auxerre è temperato ed è influenzato dall'Atlantico, per cui è freddo ma non gelido in inverno, e piacevolmente caldo in estate; tuttavia subisce alcune influenze continentali, per cui può essere a volte molto freddo in inverno e molto caldo in estate.
La città si trova nel centro-nord della Francia, in Borgogna, a sud-est di Parigi.
La temperatura media del mese più freddo (gennaio) è di 3,6 °C, quella del mese più caldo (luglio) è di 20,3 °C. Ecco le temperature medie.

Le precipitazioni ammontano a 705 mm all'anno: sono dunque ad un livello intermedio. Nei mesi meno piovosi (febbraio, marzo) cadono 50 mm di pioggia, nei più piovosi (maggio, ottobre) ne cadono 70. Ecco le precipitazioni medie.

In media, si contano circa 1.770 ore di sole all'anno. Ecco la media delle ore di sole al giorno.

Quando andare

Il periodo migliore per visitare Auxerre va da metà maggio a metà settembre, essendo il più caldo e soleggiato dell'anno. Se è vero che qualche volta può fare molto caldo a luglio e agosto, in altre circostanze, di notte può fare fresco o persino un po' freddo anche in questi mesi, per cui conviene portare una felpa o un maglione e una giacca leggera per la sera.