Il clima di Manzanillo è tropicale, caldo tutto l'anno, con un periodo secco e meno caldo da dicembre ad aprile, e un periodo afoso e piovoso da giugno a ottobre.
La città si trova sulla costa meridionale del Messico, nello stato di Colima.
Da giugno a novembre (ma con una maggiore probabilità da agosto a ottobre), vi è il rischio degli uragani. Ad esempio, la città fu duramente colpita da un uragano nell'ottobre del 1959.
La temperatura media del mese più freddo (marzo) è di 24,3 °C, quella dei mesi più caldi (luglio, agosto) è di 28,7 °C. Ecco le temperature medie.

Le precipitazioni ammontano a 970 mm all'anno: sono dunque ad un livello intermedio. Nei mesi meno piovosi (febbraio, marzo, aprile) cadono 5 mm di pioggia, nel più piovoso (settembre) ne cadono 270. Ecco le precipitazioni medie.

In media, si contano circa 2.855 ore di sole all'anno. Ecco la media delle ore di sole al giorno.

La temperatura del mare oscilla tra 25 °C e 30 °C. E' dunque abbastanza elevata per fare il bagno tutto l'anno. Ecco le temperature medie del mare.

Quando andare

Si può andare a Manzanillo da dicembre ad aprile, dato che è un periodo secco e al di fuori della stagione degli uragani. Ogni tanto la temperatura minima può scendere fino a 15 °C, per cui può essere utile una felpa per la sera.