Il clima di Mexicali è sub-tropicale desertico, molto mite in inverno e caldissimo in estate.
La città si trova nello stato della Bassa California, al confine con la California. In inverno in genere c'è il sole, e di giorno la temperatura raggiunge o supera i 20 °C, mentre di notte fa abbastanza freddo. A volte ci possono essere periodi più freddi del solito, in cui la temperatura scende a qualche grado sotto lo zero di notte, anche se di giorno supera i 10 °C.
In estate, siamo nella zona più calda del Messico, e una delle più calde del Nord America, perché le montagne la isolano dalle correnti del Pacifico, mentre il Golfo di California a sud è chiuso e caldo. In genere le giornate più calde dell'anno si verificano a giugno o inizio luglio. Il record del caldo è di 52 °C. A luglio e agosto c'è un leggero aumento dell'umidità che rende il caldo ancora più sgradevole.
Da giugno a novembre, ma con una probabilità più elevata da agosto a ottobre, la città può essere raggiunta dai resti degli uragani del Pacifico, che risalgono dalle regioni tropicali dopo aver attraversato la Bassa California. Comunque, a giugno gli uragani sono rari, il mese in cui sono più frequenti è settembre, e storicamente a novembre non si sono mai verificati.
La temperatura media dei mesi più freddi (gennaio, dicembre) è di 13 °C, quella del mese più caldo (luglio) è di 34 °C. Ecco le temperature medie.

Le precipitazioni ammontano a 84 mm all'anno: sono dunque ad un livello desertico. Nel mese meno piovoso (giugno) cadono 0 mm di pioggia, nel più piovoso (dicembre) ne cadono 13. Le rare piogge si verificano in inverno e in estate. In estate sono dovute all'aria umida che risale dal Golfo di California, e a volte dai resti dei cicloni tropicali che possono raggiungere la zona. Ecco le precipitazioni medie.

In media, si contano circa 3.970 ore di sole all'anno. Il sole brilla dunque molto spesso, anzi siamo in una delle città più soleggiate al mondo. Ecco la media delle ore di sole al giorno.

Quando andare

Il periodo migliore per visitare Mexicali va da novembre a marzo. L'inverno, da dicembre a febbraio, è in genere una stagione mite e soleggiata, anche se a volte può piovere, oppure può fare un po' freddo (soprattutto a dicembre e gennaio). Si possono dunque scegliere i mesi di marzo e novembre.