Il clima di Kautokeino è continentale freddo, con inverni gelidi ed estati miti.
La città si trova nel nord della Norvegia, nella parte continentale del Finmark, a 380 metri di quota. Dato che siamo al 69° parallelo, quindi a nord del Circolo polare artico, il sole non sorge (notte polare) dal 2 dicembre al 10 gennaio, e non tramonta (sole a mezzanotte) dal 22 maggio al 23 luglio. Le notti bianche si verificano già dal 14 aprile e fino al 30 agosto.
In inverno la temperatura può arrivare a -35/-40 °C nei giorni più freddi. Nel gennaio 1987 è arrivata a -43,5 °C, e nel gennaio 1999 persino a -50 °C. A volte la temperatura notturna può scendere fino a 0 °C anche in estate. Invece, nel luglio 2014 e 2018, la temperatura è arrivata a 30 °C. Ad agosto la temperatura comincia già a diminuire rispetto a luglio.
La temperatura media del mese più freddo (gennaio) è di -14,8 °C, quella del mese più caldo (luglio) è di 12,2 °C. Ecco le temperature medie.

Le precipitazioni ammontano a 405 mm all'anno: sono dunque abbastanza scarse. Nei mesi meno piovosi (febbraio, marzo) cadono 15 mm di pioggia (o neve), nel più piovoso (luglio) ne cadono 70. Ecco le precipitazioni medie.

Quando andare

Il periodo migliore per visitare Kautokeino è l'estate, da giugno ad agosto, essendo la stagione meno fredda. Vanno comunque messi in conto cieli nuvolosi, pioggia e un po' di freddo notturno.